配列名:Phaseolus acutifolius Frijol Bayo genome v1
ゲノム配列名 | Phaseolus acutifolius Frijol Bayo genome v1 | 系統名 | Frijol Bayo |
配列数 | 155 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 512,626,114 | N50長 (bp) | 45,193,024 |
遺伝子の数 | 27,538 | 遺伝子数由来ファイル | Pacutifolius_580_v1.0.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio long reads, Hi-C | 取得した配列量 | 281.5x |
アセンブリ方法 | MECAT, ARROW, JUICER | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 513 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Phillip E. McClean (North Dakota State University) | データソース名 | JGI Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-021-22858-x | データソースURL | https://phytozome-next.jgi.doe.gov/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |