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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Capsicum baccatum , Yellow hot pepper , トウガラシ (baccatum種), キイロトウガラシ

Capsicum baccatum

Genome Assembly ID:t33114.G001

配列名:ASM227188v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM227188v2 系統名 isolate PBC81
配列数 23,260 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 3,215,610,539 N50長 (bp) 229,738,584
遺伝子の数 35,853 遺伝子数由来ファイル GCA_002271885.2_ASM227188v2_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 35,853 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 136.1x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2.04-r240; SSPACE v. 2.0; Platanus v. 1.2.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,900
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Doil Choi (Seoul National University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1186/s13059-017-1341-9 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.0%[S:96.0%,D:2.0%],F:1.1%,M:0.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:81.7%[S:80.0%,D:1.7%],F:6.0%,M:12.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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