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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ginkgo biloba , Ginkgo , イチョウ

Ginkgo biloba

Genome Assembly ID:t3311.G001

配列名:Ginkgo_biloba.scaf

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Ginkgo_biloba.scaf 系統名 TM011
配列数 6,459,773 染色体数 NA
配列長 (bp) 10,608,657,252 N50長 (bp) 1,358,237
遺伝子の数 41,840 遺伝子数由来ファイル Gb.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 125.31x
アセンブリ方法 SOAPdenovo2 v2.0.4 推定ゲノムサイズ (Mb) 10,000
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Wenbin Chen (BGI-Shenzhen) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1186/s13742-016-0154-1 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:89.2%[S:83.4%,D:5.8%],F:7.2%,M:3.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:59.2%[S:53.7%,D:5.5%],F:11.8%,M:28.9%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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