配列名:pkansuensis_v2.0
ゲノム配列名 | pkansuensis_v2.0 | 系統名 | wild accessions Hong Gen Gan Su Tao 1# |
配列数 | 338 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 253,172,573 | N50長 (bp) | 28,885,292 |
遺伝子の数 | 26,986 | 遺伝子数由来ファイル | Pka.update.pep.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II, Hi-C | 取得した配列量 | 343.99x |
アセンブリ方法 | Hifiasm v0.13-r308, ALLHiC | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 238 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Lirong Wang (Chinese Academy of Agricultural Sciences) | データソース名 | GDR: Genome Database For Rosaceae |
論文 (DOIコード) | 10.1186/s12915-022-01342-y | データソースURL | https://www.rosaceae.org/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |