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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Rubus idaeus , red raspberry , ヨーロッパキイチゴ

Rubus idaeus

Genome Assembly ID:t32247.G001

配列名:Ridaeus_Anitra_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Ridaeus_Anitra_v1.0 系統名 cv. Anitra
配列数 1,161 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 293,523,434 N50長 (bp) 34,491,998
遺伝子の数 39,448 遺伝子数由来ファイル TGSthird_ed3_masked_sequences_hard.aa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 77x
アセンブリ方法 Canu 推定ゲノムサイズ (Mb) 293
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jahn Davik (Norwegian Institute of Bioeconomy Research) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1371/journal.pone.0265096 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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