Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Carya illinoinensis , Pecan , ペカン, ピーカンナッツ

Carya illinoinensis

Genome Assembly ID:t32201.G002

配列名:Cillinoinensis_573_v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Cillinoinensis_573_v1.1 系統名 cv. Oaxaca
配列数 298 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 649,961,136 N50長 (bp) 42,346,088
遺伝子の数 31,911 遺伝子数由来ファイル Cillinoinensis_573_v1.1.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 78.94x
アセンブリ方法 MECAT v1 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jennifer J. Randall (New Mexico State University) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-021-24328-w データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット