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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Carya illinoinensis , Pecan , ペカン, ピーカンナッツ

Carya illinoinensis

Genome Assembly ID:t32201.G001

配列名:C.illinoinensisPawnee_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 C.illinoinensisPawnee_v1 系統名 Pawnee
配列数 17 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 674,433,157 N50長 (bp) 44,708,330
遺伝子の数 54,484 遺伝子数由来ファイル GCF_018687715.1_C.illinoinensisPawnee_v1_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel2 取得した配列量 52.12x
アセンブリ方法 hifiasm v. 0.5 推定ゲノムサイズ (Mb) 650
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Lihong Xiao (Zhejiang A&F University), Guangyi Fan (BGI-Shenzhen) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-021-24328-w データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.0%[S:92.1%,D:6.9%],F:0.4%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.7%[S:53.5%,D:46.2%],F:0.0%,M:0.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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