配列名:C.illinoinensisPawnee_v1
ゲノム配列名 | C.illinoinensisPawnee_v1 | 系統名 | Pawnee |
配列数 | 17 | 染色体数 | 2n = 2x = 32 |
配列長 (bp) | 674,433,157 | N50長 (bp) | 44,708,330 |
遺伝子の数 | 54,484 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_018687715.1_C.illinoinensisPawnee_v1_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel2 | 取得した配列量 | 52.12x |
アセンブリ方法 | hifiasm v. 0.5 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 650 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Lihong Xiao (Zhejiang A&F University), Guangyi Fan (BGI-Shenzhen) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-021-24328-w | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.0%[S:92.1%,D:6.9%],F:0.4%,M:0.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.7%[S:53.5%,D:46.2%],F:0.0%,M:0.3%,n:1614 |