配列名:Phypa V3.3
ゲノム配列名 | Phypa V3.3 | 系統名 | strain Gransden 2004 |
配列数 | 378 | 染色体数 | n = x = 27 |
配列長 (bp) | 473,226,588 | N50長 (bp) | 17,435,539 |
遺伝子の数 | 87,533 | 遺伝子数由来ファイル | Ppatens_318_v3.3.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 87,533 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger | 取得した配列量 | 18.49x |
アセンブリ方法 | Arachne v. 3 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 510 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Stefan A. Rensing (University of Marburg) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1111/tpj.13801 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:85.8%[S:73.7%,D:12.1%],F:2.3%,M:11.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:88.7%[S:1.1%,D:87.6%],F:1.4%,M:9.9%,n:1614 |