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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Physcomitrella patens , Spreading earthmoss , ヒメツリガネゴケ

Physcomitrella patens

Genome Assembly ID:t3218.G001

配列名:Phypa V3.3

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Phypa V3.3 系統名 strain Gransden 2004
配列数 378 染色体数 n = x = 27
配列長 (bp) 473,226,588 N50長 (bp) 17,435,539
遺伝子の数 87,533 遺伝子数由来ファイル Ppatens_318_v3.3.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 87,533 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger 取得した配列量 18.49x
アセンブリ方法 Arachne v. 3 推定ゲノムサイズ (Mb) 510
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Stefan A. Rensing (University of Marburg) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.13801 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:85.8%[S:73.7%,D:12.1%],F:2.3%,M:11.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:88.7%[S:1.1%,D:87.6%],F:1.4%,M:9.9%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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