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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chromochloris zofingiensis , Green algae , クロモクロリス, 緑藻

Chromochloris zofingiensis

Genome Assembly ID:t31302.G001

配列名:Czofingiensis_461_v5

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Czofingiensis_461_v5 系統名 strain SAG 211-14
配列数 220 染色体数 n = x = 19
配列長 (bp) 60,363,192 N50長 (bp) 3,274,445
遺伝子の数 15,369 遺伝子数由来ファイル Czofingiensis_461_v5.2.3.2.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 15,369 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, OpGen 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Jellyfish, ABySS, Ray, MapCards 推定ゲノムサイズ (Mb) 58
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Krishna K. Niyogi (University of California), Sabeeha S. Merchant (ditto), Matteo Pellegrini (ditto) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1073/pnas.1619928114 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット chlorophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:95.4%[S:93.7%,D:1.7%],F:2.1%,M:2.5%,n:1519 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:88.7%[S:86.1%,D:2.6%],F:5.2%,M:6.1%,n:1519

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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