配列名:Czofingiensis_461_v5
ゲノム配列名 | Czofingiensis_461_v5 | 系統名 | strain SAG 211-14 |
配列数 | 220 | 染色体数 | n = x = 19 |
配列長 (bp) | 60,363,192 | N50長 (bp) | 3,274,445 |
遺伝子の数 | 15,369 | 遺伝子数由来ファイル | Czofingiensis_461_v5.2.3.2.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 15,369 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio, OpGen | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | Jellyfish, ABySS, Ray, MapCards | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 58 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Krishna K. Niyogi (University of California), Sabeeha S. Merchant (ditto), Matteo Pellegrini (ditto) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1073/pnas.1619928114 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | chlorophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:95.4%[S:93.7%,D:1.7%],F:2.1%,M:2.5%,n:1519 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:88.7%[S:86.1%,D:2.6%],F:5.2%,M:6.1%,n:1519 |