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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Zoysia japonica , Japanese lawn grass , シバ

Zoysia japonica

Genome Assembly ID:t309978.G001

配列名:Zjn_r1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Zjn_r1.1 系統名 Nagirizaki
配列数 20 染色体数 2n = 4x = 40
配列長 (bp) 273,735,632 N50長 (bp) 17,914,192
遺伝子の数 59,271 遺伝子数由来ファイル ZJN_r1.1.pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 59,271 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 150x
アセンブリ方法 Platanus v. 1.2.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 390
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shusei Sato (Tohoku University) データソース名 Zoysia Genome Database
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsw006 データソースURL http://zoysia.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:92.6%[S:82.3%,D:10.3%],F:0.7%,M:6.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:38.0%[S:33.5%,D:4.5%],F:25.9%,M:36.1%,n:1614

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染色体 /
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fasta
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