配列名:Zjn_r1.1
ゲノム配列名 | Zjn_r1.1 | 系統名 | Nagirizaki |
配列数 | 20 | 染色体数 | 2n = 4x = 40 |
配列長 (bp) | 273,735,632 | N50長 (bp) | 17,914,192 |
遺伝子の数 | 59,271 | 遺伝子数由来ファイル | ZJN_r1.1.pep |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 59,271 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 150x |
アセンブリ方法 | Platanus v. 1.2.1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 390 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Shusei Sato (Tohoku University) | データソース名 | Zoysia Genome Database |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsw006 | データソースURL | http://zoysia.kazusa.or.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:92.6%[S:82.3%,D:10.3%],F:0.7%,M:6.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:38.0%[S:33.5%,D:4.5%],F:25.9%,M:36.1%,n:1614 |