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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chlorella vulgaris , Green algae , クロレラ (vulgaris種), 緑藻

Chlorella vulgaris

Genome Assembly ID:t3077.G002

配列名:cvul

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 cvul 系統名 211/11P
配列数 45 染色体数 2n = 16
配列長 (bp) 40,437,856 N50長 (bp) 2,825,136
遺伝子の数 11,141 遺伝子数由来ファイル GCA_023343905.1_cvul_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 11,141 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII, BioNano optical mapping 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 FALCON v1.8.7, BioNano Solve pipeline v5678.6119rel, RefAligner v.6119 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A hybrid assembly combining the PacBio assembly with the optical map was performed with the Bionano Solve Pipeline (v5678.6119rel), RefAligner (v.6119). Synonym: Chlorella vulgaris var. viridis
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Matteo Ballottari (University of Verona) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.14508 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.2.2 BUSCO データセット chlorophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.5%[S:96.2%,D:0.3%],F:1.3%,M:2.2%,n:1519 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.9%[S:96.5%,D:2.4%],F:0.2%,M:0.9%,n:1519

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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