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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chlorella protothecoides , Green algae , クロレラ (protothecoides種), 緑藻

Chlorella protothecoides

Genome Assembly ID:t3075.G001

配列名:ASM73321v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM73321v1 系統名 strain 0710
配列数 374 染色体数 NA
配列長 (bp) 22,924,637 N50長 (bp) 285,543
遺伝子の数 7,014 遺伝子数由来ファイル GCF_000733215.1_ASM73321v1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 7,014 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Roche 454 取得した配列量 159x
アセンブリ方法 SOAP de novo 2.01, Newbler v2.6, Amos 3.1.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 28
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Qingyu Wu (Tsinghua University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1186/1471-2164-15-582 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.2.2 BUSCO データセット chlorophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:93.3%[S:93.0%,D:0.3%],F:2.0%,M:4.7%,n:1519 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.9%[S:93.4%,D:0.5%],F:2.2%,M:3.9%,n:1519

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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