配列名:Chlamydomonas_reinhardtii_v5.6
ゲノム配列名 | Chlamydomonas_reinhardtii_v5.6 | 系統名 | strain CC-503 cw92 mt+ |
配列数 | 54 | 染色体数 | 1n = x = 17 |
配列長 (bp) | 111,100,715 | N50長 (bp) | 7,783,580 |
遺伝子の数 | 19,526 | 遺伝子数由来ファイル | Creinhardtii_281_v5.6.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 19,526 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | ABI 3739 | 取得した配列量 | 11.12x |
アセンブリ方法 | ARACHNE v. 20071016_modified | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 121 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A cell wall-deficient mutant isolated from strain 137c |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Daniel S. Rokhsar (U.S. Department of Energy (DOE) Joint Genome Institute (JGI)), Arthur R. Grossman (Carnegie Institution) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1126/science.1143609 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | chlorophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.1%[S:96.8%,D:0.3%],F:1.4%,M:1.5%,n:1519 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.0%[S:92.9%,D:6.1%],F:0.3%,M:0.7%,n:1519 |