Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chlamydomonas reinhardtii , Chlamydomonas, Green algae , クラミドモナス, コナミドリムシ, 緑藻

Chlamydomonas reinhardtii

Genome Assembly ID:t3055.G001

配列名:Chlamydomonas_reinhardtii_v5.6

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Chlamydomonas_reinhardtii_v5.6 系統名 strain CC-503 cw92 mt+
配列数 54 染色体数 1n = x = 17
配列長 (bp) 111,100,715 N50長 (bp) 7,783,580
遺伝子の数 19,526 遺伝子数由来ファイル Creinhardtii_281_v5.6.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 19,526 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 ABI 3739 取得した配列量 11.12x
アセンブリ方法 ARACHNE v. 20071016_modified 推定ゲノムサイズ (Mb) 121
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A cell wall-deficient mutant isolated from strain 137c
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Daniel S. Rokhsar (U.S. Department of Energy (DOE) Joint Genome Institute (JGI)), Arthur R. Grossman (Carnegie Institution) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1126/science.1143609 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット chlorophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.1%[S:96.8%,D:0.3%],F:1.4%,M:1.5%,n:1519 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.0%[S:92.9%,D:6.1%],F:0.3%,M:0.7%,n:1519

遺伝子をさがす

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット