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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Sesamum alatum , Winged-seed sesame, Wild sesame , 野生ゴマ, ゴマ野生種 (alatum種)

Sesamum alatum

Genome Assembly ID:t300844.G002

配列名:Sala_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Sala_v1.0 系統名 Toyama Ala1
配列数 29 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 534,647,785 N50長 (bp) 39,759,466
遺伝子の数 24,854 遺伝子数由来ファイル S.alatum_hic_annotation_v1.0_protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina PE, PacBio CLR, Hi-C 取得した配列量 325x
アセンブリ方法 Canu v2.1.1; Arrow (gcpp 1.0.0-SL-release-8.0.0); Pilon v1.24; YaHS v1.2a.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 537
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Masayuki Yamamoto (Toyama University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.4.3 BUSCO データセット eudicots_odb10
BUSCO ゲノム C:98.4%[S:93.1%,D:5.3%],F:0.5%,M:1.1%,n:2326 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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