配列名:Vitis_vinifera.12X
ゲノム配列名 | Vitis_vinifera.12X | 系統名 | PN40024 |
配列数 | 33 | 染色体数 | 2n = 2x = 38 |
配列長 (bp) | 486,265,422 | N50長 (bp) | 23,006,712 |
遺伝子の数 | 29,927 | 遺伝子数由来ファイル | Vitis_vinifera.12X.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 29,927 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger | 取得した配列量 | 12x |
アセンブリ方法 | ARACHNE | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 416 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | The French_Italian Public Consortium for Grapevine Genome Characterization, Patrick Wincker (Genoscope, CEA) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature06148 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.5%[S:95.9%,D:1.6%],F:1.9%,M:0.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:94.0%[S:92.3%,D:1.7%],F:4.3%,M:1.7%,n:1614 |