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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Vitis vinifera , Grapevine, Grape , ブドウ欧州種, ヨーロッパブドウ

Vitis vinifera

Genome Assembly ID:t29760.G001

配列名:Vitis_vinifera.12X

ゲノム配列の詳細

配列名 Vitis_vinifera.12X 系統名 PN40024
配列数 33 染色体数 2n = 2x = 38
配列長 (bp) 486,265,422 N50長 (bp) 23,006,712
遺伝子の数 29,927 遺伝子数由来ファイル Vitis_vinifera.12X.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 29,927 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger 取得した配列量 12x
アセンブリ方法 ARACHNE 推定ゲノムサイズ (Mb) 416
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 10.1038/nature06148 責任著者 The French–Italian Public Consortium for Grapevine Genome Characterization, Patrick Wincker (Genoscope, CEA)
データソース名 Ensembl データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.5%[S:95.9%,D:1.6%],F:1.9%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.0%[S:92.3%,D:1.7%],F:4.3%,M:1.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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