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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gossypium arboreum , Asian cotton , ワタ (arboreum種), キダチワタ

Gossypium arboreum

Genome Assembly ID:t29729.G003

配列名:arboreum_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 arboreum_v1.0 系統名 cv. Shixiya1, SXY1
配列数 75,419 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 1,694,597,732 N50長 (bp) 121,339,338
遺伝子の数 47,568 遺伝子数由来ファイル GCF_000612285.1_Gossypium_arboreum_v1.0_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina Hiseq2000 取得した配列量 110x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2.01 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,746
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jonathan F Wendel( Iowa State University), Kunbo Wang(Chinese Academy of Agricultural Sciences), Xianlong Zhang(Huazhong Agricultural University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/molbev/msab128 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.9%[S:92.3%,D:6.6%],F:0.7%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.3%[S:64.7%,D:34.6%],F:0.3%,M:0.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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