配列名:arboreum_v1.0
ゲノム配列名 | arboreum_v1.0 | 系統名 | cv. Shixiya1, SXY1 |
配列数 | 75,419 | 染色体数 | 2n = 2x = 26 |
配列長 (bp) | 1,694,597,732 | N50長 (bp) | 121,339,338 |
遺伝子の数 | 47,568 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_000612285.1_Gossypium_arboreum_v1.0_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina Hiseq2000 | 取得した配列量 | 110x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2.01 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,746 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jonathan F Wendel( Iowa State University), Kunbo Wang(Chinese Academy of Agricultural Sciences), Xianlong Zhang(Huazhong Agricultural University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1093/molbev/msab128 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.9%[S:92.3%,D:6.6%],F:0.7%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.3%[S:64.7%,D:34.6%],F:0.3%,M:0.4%,n:1614 |