配列名:BGI-A2
ゲノム配列名 | BGI-A2 | 系統名 | cv. Shixiya1, SXY1 |
配列数 | 75,594 | 染色体数 | 2n = 4x = 52 |
配列長 (bp) | 1,694,649,772 | N50長 (bp) | 121,338,753 |
遺伝子の数 | 40,134 | 遺伝子数由来ファイル | G.arboreum_BGI-A2_v1.0_protein.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 40,134 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 110x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2.01 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,746 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | The descendant derived from 18 successive generations of self-fertilization of the cultivated diploid cotton Shixiya1. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | John Z. Yu (USDA-ARS), Yuxian Zhu (Wuhan University) | データソース名 | COTTON GEN |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.2987 | データソースURL | https://www.cottongen.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.9%[S:92.3%,D:6.6%],F:0.7%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:94.7%[S:87.9%,D:6.8%],F:2.2%,M:3.1%,n:1614 |