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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gossypium arboreum , Asian cotton , ワタ (arboreum種), キダチワタ

Gossypium arboreum

Genome Assembly ID:t29729.G001

配列名:BGI-A2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 BGI-A2 系統名 cv. Shixiya1, SXY1
配列数 75,594 染色体数 2n = 4x = 52
配列長 (bp) 1,694,649,772 N50長 (bp) 121,338,753
遺伝子の数 40,134 遺伝子数由来ファイル G.arboreum_BGI-A2_v1.0_protein.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 40,134 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 110x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2.01 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,746
シーケンシングの方法のコメント NA コメント The descendant derived from 18 successive generations of self-fertilization of the cultivated diploid cotton Shixiya1.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 John Z. Yu (USDA-ARS), Yuxian Zhu (Wuhan University) データソース名 COTTON GEN
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.2987 データソースURL https://www.cottongen.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.9%[S:92.3%,D:6.6%],F:0.7%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.7%[S:87.9%,D:6.8%],F:2.2%,M:3.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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