配列名:TDr96_F1_v2_PseudoChromosome.rev07_lg8_w22 25
ゲノム配列名 | TDr96_F1_v2_PseudoChromosome.rev07_lg8_w22 25 | 系統名 | subsp. rotundata, cv. TDr96_F1 |
配列数 | 2,254 | 染色体数 | 2n = 2x = 40 |
配列長 (bp) | 584,308,608 | N50長 (bp) | 23,441,323 |
遺伝子の数 | 33,298 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_009730915.1_TDr96_F1_v2_PseudoChromosome.rev07_lg8_w22_25.fasta_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Nanopore PromethION | 取得した配列量 | 34x |
アセンブリ方法 | flye v. 2.4.2; pilon v. 1.23; Purge Haplotigs v. 1.0.4; MSTmap | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 584 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Synonym: Dioscorea rotundata |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Cedric Mariac(Institut de Recherche pour le Developpement, UMR DIADE), Yves Vigouroux(Institut de Recherche pour le Developpement, UMR DIADE), Thomas L. P. Couvreur(Institut de Recherche pour le Developpement, UMR DIADE, Universite de Yaounde I, Ecole Normale Superieure, Departement des Sciences Biologiques, Laboratoire de Botanique, Systematique et d'Ecologie) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1111/1755-0998.12258 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |