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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Dioscorea cayenensis subsp. rotundata , Guinea yam (ssp. rotundata) , ギニアヤム (rotundata変種)

Dioscorea cayenensis

Genome Assembly ID:t29710.G002

配列名:TDr96_F1_v2_PseudoChromosome.rev07_lg8_w22 25

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 TDr96_F1_v2_PseudoChromosome.rev07_lg8_w22 25 系統名 subsp. rotundata, cv. TDr96_F1
配列数 2,254 染色体数 2n = 2x = 40
配列長 (bp) 584,308,608 N50長 (bp) 23,441,323
遺伝子の数 33,298 遺伝子数由来ファイル GCF_009730915.1_TDr96_F1_v2_PseudoChromosome.rev07_lg8_w22_25.fasta_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Nanopore PromethION 取得した配列量 34x
アセンブリ方法 flye v. 2.4.2; pilon v. 1.23; Purge Haplotigs v. 1.0.4; MSTmap 推定ゲノムサイズ (Mb) 584
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Synonym: Dioscorea rotundata
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Cedric Mariac(Institut de Recherche pour le Developpement, UMR DIADE), Yves Vigouroux(Institut de Recherche pour le Developpement, UMR DIADE), Thomas L. P. Couvreur(Institut de Recherche pour le Developpement, UMR DIADE, Universite de Yaounde I, Ecole Normale Superieure, Departement des Sciences Biologiques, Laboratoire de Botanique, Systematique et d'Ecologie) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1111/1755-0998.12258 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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