配列名:TDr96_F1_Pseudo_Chromosome_v1.0
ゲノム配列名 | TDr96_F1_Pseudo_Chromosome_v1.0 | 系統名 | subsp. rotundata, cv. TDr96_F1 |
配列数 | 21 | 染色体数 | 2n = 2x = 40 |
配列長 (bp) | 456,674,974 | N50長 (bp) | 25,272,979 |
遺伝子の数 | 19,023 | 遺伝子数由来ファイル | Dioscorea_rotundata.TDr96_F1_Pseudo_Chromosome_v1.0.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 19,023 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 100x |
アセンブリ方法 | Allpaths-LG v. r49856, SSPACE Premium v. 2.3 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 580 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Synonym: Dioscorea rotundata |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Hiroko Takagi (Japan International Research Center for Agricultural Sciences), Robert Asiedu (International Institute of Tropical Agriculture), Ryohei Terauchi (Iwate Biotechnology Research Center) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1186/s12915-017-0419-x | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |