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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Sequoia sempervirens , Coast redwood , セコイア (sempervirens種)

Sequoia sempervirens

Genome Assembly ID:t28980.G001

配列名:GCA_007258455.2_SESE.2.2_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_007258455.2_SESE.2.2_genomic 系統名 SESE104
配列数 393,407 染色体数 2n = 6x = 66
配列長 (bp) 26,549,681,935 N50長 (bp) 45,116,641
遺伝子の数 118,906 遺伝子数由来ファイル SESE.2_1.peptides.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Dovetail Chicago, Hi-C, Oxford Nonopore 取得した配列量 122x(Illumina), 39x(Dovetail Chicago), 39x(Hi-C), 22x(Hi-C)
アセンブリ方法 MaSuRCA version 3.2.8 推定ゲノムサイズ (Mb) 31,500
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Used hybrid mode
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Patrick E McGuire (UC Davis) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/g3journal/jkab380 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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