配列名:Sapria_himalayana_v1
ゲノム配列名 | Sapria_himalayana_v1 | 系統名 | NA |
配列数 | 128,027 | 染色体数 | NA |
配列長 (bp) | 1,276,270,856 | N50長 (bp) | 952,963 |
遺伝子の数 | 0 | 遺伝子数由来ファイル | NA |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | 10x genomics, Oxford Nanopore | 取得した配列量 | 162.5 Gb (10x), 36.5 Gb (ONT) |
アセンブリ方法 | SuperNova v2.1.1, ARKS v1.0.3, LINKS v1.8.5, BWA v0.7.17 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3000 to 3500 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Charles C. Davis (Harvard University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1016/j.cub.2020.12.045 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |