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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Speranskia yunnanensis , Speranskia yunnanensis , Speranskia yunnanensis

Speranskia yunnanensis

Genome Assembly ID:t2857522.G001

配列名:Syu.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Syu.genome 系統名 wild accession
配列数 195 染色体数 2n = 14
配列長 (bp) 417,645,011 N50長 (bp) 12,521,520
遺伝子の数 25,141 遺伝子数由来ファイル Syu.clean.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 18.73 Gb(Illumina), 31.35 Gb(Oxford Nanopore), 65.16 Gb(Hi-C)
アセンブリ方法 NextDenovo v2.4.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 453
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Bin Tian (Southwest Forestry University) データソース名 figshare
論文 (DOIコード) 10.3389/fgene.2021.755564 データソースURL https://figshare.com/articles/dataset/Speranskia_yunnanensis/15057930
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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