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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chiococca alba , snowberry , キオコッカ・アルバ, スノーベリー

Chiococca alba

Genome Assembly ID:t28527.G001

配列名:snowberry

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 snowberry 系統名 wild accession
配列数 3,518 染色体数 2n = 2x = 12-14
配列長 (bp) 557,689,917 N50長 (bp) 2,354,703
遺伝子の数 43,217 遺伝子数由来ファイル snowberry_final_asm.hc_models.pep.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 10x Genomics 取得した配列量 86x(paired-end), 30x(mate-pair), 70x(10x genomics raw), 48x(10x genomics effective coverage)
アセンブリ方法 NextClip (v1.3.1) for ALLPATHS-LG, Supernova (v2.0.0) for 10x genomics 推定ゲノムサイズ (Mb) 567(flow cytometry), from480 to 537(k-mer)
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 C Robin Buell (Michigan State University) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsaa013 データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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