配列名:snowberry
ゲノム配列名 | snowberry | 系統名 | wild accession |
配列数 | 3,518 | 染色体数 | 2n = 2x = 12-14 |
配列長 (bp) | 557,689,917 | N50長 (bp) | 2,354,703 |
遺伝子の数 | 43,217 | 遺伝子数由来ファイル | snowberry_final_asm.hc_models.pep.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 10x Genomics | 取得した配列量 | 86x(paired-end), 30x(mate-pair), 70x(10x genomics raw), 48x(10x genomics effective coverage) |
アセンブリ方法 | NextClip (v1.3.1) for ALLPATHS-LG, Supernova (v2.0.0) for 10x genomics | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 567(flow cytometry), from480 to 537(k-mer) |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | C Robin Buell (Michigan State University) | データソース名 | DRYAD |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsaa013 | データソースURL | https://datadryad.org |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |