Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Pogostemon cablin , Patchouli , パチョリ

Pogostemon cablin

Genome Assembly ID:t28511.G002

配列名:GWHBAZF00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBAZF00000000 系統名 NA
配列数 988 染色体数 2n = 4x = 64
配列長 (bp) 1,941,516,370 N50長 (bp) 30,325,545
遺伝子の数 132,408 遺伝子数由来ファイル GWHBAZF00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Oxford Nanopore, Illumina (NovaSeq) 取得した配列量 160x (PacBio), 135x (Hi-C), 60x (Illumina)
アセンブリ方法 Canu v2.0, smrtlink v8.0, 3D-DNA, Juicebox v1.11.08 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,040
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hong-bin Wang (Guangzhou University of Chinese Medicine) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-022-31121-w データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット