配列名:Ahypochondriacus_459_v2.0
ゲノム配列名 | Ahypochondriacus_459_v2.0 | 系統名 | cv. Plainsman |
配列数 | 908 | 染色体数 | 2n = 2x = 32 |
配列長 (bp) | 403,889,442 | N50長 (bp) | 24,364,990 |
遺伝子の数 | 23,879 | 遺伝子数由来ファイル | Ahypochondriacus_459_v2.1.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 23,879 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Hi-C | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | ALLPATHS-LG, ABySS | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 466 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | P. J. Maughan (Brigham Young University) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1186/s12915-017-0412-4 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.0%[S:94.6%,D:2.4%],F:1.3%,M:1.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:80.7%[S:78.5%,D:2.2%],F:8.8%,M:10.5%,n:1614 |