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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Amaranthus hypochondriacus , Grain amaranth , アマランサス

Amaranthus hypochondriacus

Genome Assembly ID:t28502.G001

配列名:Ahypochondriacus_459_v2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Ahypochondriacus_459_v2.0 系統名 cv. Plainsman
配列数 908 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 403,889,442 N50長 (bp) 24,364,990
遺伝子の数 23,879 遺伝子数由来ファイル Ahypochondriacus_459_v2.1.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 23,879 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 ALLPATHS-LG, ABySS 推定ゲノムサイズ (Mb) 466
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 P. J. Maughan (Brigham Young University) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1186/s12915-017-0412-4 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.0%[S:94.6%,D:2.4%],F:1.3%,M:1.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:80.7%[S:78.5%,D:2.2%],F:8.8%,M:10.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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