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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Porphyra umbilicalis , Laver , チシマクロノリ

Porphyra umbilicalis

Genome Assembly ID:t2786.G001

配列名:P_umbilicalis_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 P_umbilicalis_v1 系統名 Pum1
配列数 2,126 染色体数 NA
配列長 (bp) 87,888,981 N50長 (bp) 202,021
遺伝子の数 13,567 遺伝子数由来ファイル GCA_002049455.2_P_umbilicalis_v1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 13,360 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 26.9 Gb
アセンブリ方法 Falcon v2.0 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Susan H. Brawley (University of Maine) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1073/pnas.1703088114 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:8.1%[S:7.8%,D:0.3%],F:1.3%,M:90.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:7.1%[S:6.3%,D:0.7%],F:2.1%,M:90.8%,n:1614

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fasta
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