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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Sphagnum divinum , Peat moss , ムラサキミズゴケ

Sphagnum divinum

Genome Assembly ID:t2779801.G001

配列名:S.magellanicum v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 S.magellanicum v1.1 系統名 NA
配列数 31 染色体数 n = 19
配列長 (bp) 439,011,478 N50長 (bp) 23,152,942
遺伝子の数 46,801 遺伝子数由来ファイル GCA_021904315.1_S.magellanicum_v1.1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 46,801 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 70x
アセンブリ方法 MECAT v.1.2 推定ゲノムサイズ (Mb) 424
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 A. Jonathan Shaw (Duke University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-022-01333-5 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:87.2%[S:76.5%,D:10.7%],F:2.1%,M:10.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:89.0%[S:42.5%,D:46.5%],F:2.2%,M:8.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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