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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cyanidium caldarium , Red algae , イデユコゴメ

Cyanidium caldarium

Genome Assembly ID:t2771.G001

配列名:NCBI_CDCA_GCA_026184775.1_ASM2618477v1_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 NCBI_CDCA_GCA_026184775.1_ASM2618477v1_genomic 系統名 Strain 063 E5
配列数 20 染色体数 2n = 10
配列長 (bp) 8,787,356 N50長 (bp) 488,039
遺伝子の数 4,870 遺伝子数由来ファイル CDCA_063_E5_210216_4870proteins.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel I, Illumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 MaSuRCA v3.4.2, miniasm v0.3-r179 推定ゲノムサイズ (Mb) 10
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hwan Su Yoon (Sungkyunkwan University) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-022-35566-x データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:8.7%[S:8.5%,D:0.2%],F:0.9%,M:90.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:9.7%[S:9.3%,D:0.4%],F:1.5%,M:88.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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