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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Asparagus kiusianus , Wild asparagus , ハマタマボウキ, アスパラガス野生種

Asparagus kiusianus

Genome Assembly ID:t272855.G004

配列名:AKIK2p2_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 AKIK2p2_r1.0 系統名 AKIK2p2
配列数 11 染色体数 2n = 2x = 10
配列長 (bp) 1,579,835,305 N50長 (bp) 171,835,019
遺伝子の数 58,694 遺伝子数由来ファイル AKIK2p2.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 74x
アセンブリ方法 Supernova 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント Linked reads コメント Female plant, K1, phase 2
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsac002 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:90.5%[S:87.2%,D:3.3%],F:6.1%,M:3.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:88.2%[S:83.6%,D:4.6%],F:8.2%,M:3.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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