配列名:AKIK2p1_r1.0
ゲノム配列名 | AKIK2p1_r1.0 | 系統名 | AKIK2p1 |
配列数 | 11 | 染色体数 | 2n = 2x = 10 |
配列長 (bp) | 1,580,155,615 | N50長 (bp) | 172,460,497 |
遺伝子の数 | 57,523 | 遺伝子数由来ファイル | AKIK2p1.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 74x |
アセンブリ方法 | Supernova | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | Linked reads | コメント | Female plant, K1, phase 1 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsac002 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:90.5%[S:87.2%,D:3.3%],F:6.0%,M:3.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:88.5%[S:84.0%,D:4.5%],F:8.0%,M:3.5%,n:1614 |