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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Asparagus kiusianus , Wild asparagus , ハマタマボウキ, アスパラガス野生種

Asparagus kiusianus

Genome Assembly ID:t272855.G001

配列名:AKIK1p1_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 AKIK1p1_r1.0 系統名 AKIK1p1
配列数 11 染色体数 2n = 2x = 10
配列長 (bp) 1,630,046,937 N50長 (bp) 179,686,458
遺伝子の数 59,208 遺伝子数由来ファイル AKIK1p1.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 84x
アセンブリ方法 Supernova 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント Linked reads コメント Male plant, K1, phase 1
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsac002 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:90.6%[S:87.9%,D:2.7%],F:5.9%,M:3.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:87.7%[S:82.7%,D:5.0%],F:7.8%,M:4.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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