配列名:AKIK1p1_r1.0
ゲノム配列名 | AKIK1p1_r1.0 | 系統名 | AKIK1p1 |
配列数 | 11 | 染色体数 | 2n = 2x = 10 |
配列長 (bp) | 1,630,046,937 | N50長 (bp) | 179,686,458 |
遺伝子の数 | 59,208 | 遺伝子数由来ファイル | AKIK1p1.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 84x |
アセンブリ方法 | Supernova | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | Linked reads | コメント | Male plant, K1, phase 1 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsac002 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:90.6%[S:87.9%,D:2.7%],F:5.9%,M:3.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:87.7%[S:82.7%,D:5.0%],F:7.8%,M:4.5%,n:1614 |