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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Sesamum latifolium , Wild sesame , 野生ゴマ, ゴマ野生種 (latifolium種)

Sesamum latifolium

Genome Assembly ID:t2727402.G002

配列名:Slat_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Slat_v1.0 系統名 Toyama Lat1
配列数 90 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 391,219,216 N50長 (bp) 13,657,600
遺伝子の数 24,346 遺伝子数由来ファイル S.latiforium_annotation_v1.0_protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina PE, Nanopore ONT 取得した配列量 119x
アセンブリ方法 Nextdenovo v2.5.0; NextPolish v1.4.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 440
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Masayuki Yamamoto (Toyama University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.4.3 BUSCO データセット eudicots_odb10
BUSCO ゲノム C:98.2%[S:92.5%,D:5.7%],F:0.6%,M:1.2%,n:2326 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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