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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Macrotyloma uniflorum , Horsegram, Madras bean , ホースグラム

Macrotyloma uniflorum

Genome Assembly ID:t271171.G001

配列名:MUN_r1.11

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 MUN_r1.11 系統名 cv. HPK4
配列数 3,288 染色体数 2n = 2x = 20,22
配列長 (bp) 296,778,765 N50長 (bp) 28,154,654
遺伝子の数 36,105 遺伝子数由来ファイル MUN_r1.1.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 36,105 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 llumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 SOAPdenovo2, SSPACE2.0, Platanus, MaSuRCA, GM closer 推定ゲノムサイズ (Mb) 344
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Horse gram DataBase
論文 (DOIコード) 10.46471/gigabyte.30 データソースURL http://horsegram.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.3%[S:97.2%,D:2.1%],F:0.5%,M:0.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:91.9%[S:89.4%,D:2.5%],F:2.3%,M:5.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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