配列名:MUN_r1.11
ゲノム配列名 | MUN_r1.11 | 系統名 | cv. HPK4 |
配列数 | 3,288 | 染色体数 | 2n = 2x = 20,22 |
配列長 (bp) | 296,778,765 | N50長 (bp) | 28,154,654 |
遺伝子の数 | 36,105 | 遺伝子数由来ファイル | MUN_r1.1.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 36,105 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | llumina | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo2, SSPACE2.0, Platanus, MaSuRCA, GM closer | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 344 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko Isobe (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Horse gram DataBase |
論文 (DOIコード) | 10.46471/gigabyte.30 | データソースURL | http://horsegram.kazusa.or.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.3%[S:97.2%,D:2.1%],F:0.5%,M:0.2%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:91.9%[S:89.4%,D:2.5%],F:2.3%,M:5.8%,n:1614 |