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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Citrus sinensis , Orange , オレンジ

Citrus sinensis

Genome Assembly ID:t2711.G004

配列名:DVS_B1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 DVS_B1.0 系統名 cv. Valencia DVS
配列数 9 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 299,602,842 N50長 (bp) 32,342,904
遺伝子の数 80,120 遺伝子数由来ファイル GCA_022201065.1_DVS_B1.0_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 80,120 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II 取得した配列量 420x
アセンブリ方法 MECAT2, CANU v2.1 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Frederick Gmitter Jr (University of Florida) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/hr/uhac247 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.7%[S:97.1%,D:1.5%],F:0.7%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.3%[S:29.9%,D:69.3%],F:0.2%,M:0.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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