配列名:C.sinensis_v2.0_HZAU_csi
ゲノム配列名 | C.sinensis_v2.0_HZAU_csi | 系統名 | cv. Valencia |
配列数 | 10 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 327,944,670 | N50長 (bp) | 30,837,053 |
遺伝子の数 | 44,275 | 遺伝子数由来ファイル | csi.peptide.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 44,275 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 214x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2011-04 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 367 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Xiu-Xin Deng (Huazhong Agricultural University), Yijun Ruan (ditto) | データソース名 | Citrus Pan-genome to Breeding Database (CPBD) |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.2472 | データソースURL | http://citrus.hzau.edu.cn/index.php |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.3%[S:97.2%,D:1.1%],F:1.1%,M:0.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.6%[S:61.6%,D:34.0%],F:2.8%,M:1.6%,n:1614 |