Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Scalesia atractyloides , Scalesia atractyloides , Scalesia atractyloides

Scalesia atractyloides

Genome Assembly ID:t2708596.G001

配列名:Scalesia_atractyloides.renamed

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Scalesia_atractyloides.renamed 系統名 P2000-5406/C2834
配列数 1,634 染色体数 2n = 4x = 68
配列長 (bp) 3,216,878,694 N50長 (bp) 94,823,719
遺伝子の数 43,093 遺伝子数由来ファイル scalesia_atractyloides.renamed.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 197x
アセンブリ方法 wtdbg2 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,900
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Code for assembly is available. (https://github.com/jcerca/Papers/tree/main/scalesia_genome)
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jose Cerca (Norwegian University of Science and Technology) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-022-31280-w データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット