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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Citrus x limon , lemon , レモン

Citrus x limon

Genome Assembly ID:t2708.G003

配列名:GWHCBFQ00000000.1.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHCBFQ00000000.1.genome 系統名 Perfume Lemon
配列数 18 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 633,006,086 N50長 (bp) 35,596,939
遺伝子の数 62,633 遺伝子数由来ファイル GWHCBFQ00000000.1.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 25,682 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Hi-C, Oxford Nanopore 取得した配列量 70.2x(PacBio), 109.0x(Oxford Nanopore), 244.36x(Illumina), 114.58x(Hi-C)
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Muqing Zhang (Guangxi University, University of Florida) データソース名 genome warehouse
論文 (DOIコード) 10.1093/hr/uhad057, 10.1093/hr/uhad005 データソースURL https://ngdc.cncb.ac.cn/gwh
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.3%[S:89.0%,D:9.4%],F:0.6%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:86.9%[S:79.9%,D:7.0%],F:5.9%,M:7.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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