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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cuscuta chinensis , Chinese dodder , ハマネナシカズラ

Cuscuta chinensis

Genome Assembly ID:t267557.G001

配列名:Cchi_Kai_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Cchi_Kai_v1.0 系統名 Kaifu
配列数 1,237 染色体数 2n = 4x = 60
配列長 (bp) 1,509,462,550 N50長 (bp) 49,041,297
遺伝子の数 37,087 遺伝子数由来ファイル Cuscuta_chinensis_Kaifu.pep.v1.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 37,087 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,220
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Tenta Segawa (Suntory Global Innovation Center Ltd.) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1093/pcp/pcag002 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット eudicots_odb10
BUSCO ゲノム C:87.2%[S:7.1%,D:80.1%],F:1.0%,M:11.8%,n:2326 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:87.6%[S:12.9%,D:74.8%],F:0.6%,M:11.8%,n:2326

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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