配列名:NIFOS_PopDav_1.0
ゲノム配列名 | NIFOS_PopDav_1.0 | 系統名 | female tree, Odae 19 |
配列数 | 259 | 染色体数 | NA |
配列長 (bp) | 408,133,675 | N50長 (bp) | 20,279,470 |
遺伝子の数 | 31,882 | 遺伝子数由来ファイル | P.davidiana.proteins.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II, Hi-C | 取得した配列量 | 31.1x (PacBio), 118.5x (Hi-C) |
アセンブリ方法 | FALCON-Unzip, HiRise | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 375 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Synonym: Populus tremula var. davidiana |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Ki-Tae Kim (Sunchon National University) | データソース名 | NCBI; Figshare |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41597-023-02350-5 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ https://figshare.com |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |