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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Populus davidiana , Asian aspen , チョウセンヤマナラシ

Populus davidiana

Genome Assembly ID:t266767.G001

配列名:NIFOS_PopDav_1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 NIFOS_PopDav_1.0 系統名 female tree, Odae 19
配列数 259 染色体数 NA
配列長 (bp) 408,133,675 N50長 (bp) 20,279,470
遺伝子の数 31,882 遺伝子数由来ファイル P.davidiana.proteins.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 31.1x (PacBio), 118.5x (Hi-C)
アセンブリ方法 FALCON-Unzip, HiRise 推定ゲノムサイズ (Mb) 375
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Synonym: Populus tremula var. davidiana
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ki-Tae Kim (Sunchon National University) データソース名 NCBI; Figshare
論文 (DOIコード) 10.1038/s41597-023-02350-5 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
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