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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Vitis hybrid cultivar , Hybrid grape , ブドウ交配種, ハイブリッドブドウ

Vitis hybrid cultivar

Genome Assembly ID:t241073.G001

配列名:V_Chambourcin_primary_genome_assembly

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 V_Chambourcin_primary_genome_assembly 系統名 cv. Chambourcin
配列数 26 染色体数 NA
配列長 (bp) 493,554,689 N50長 (bp) 23,325,629
遺伝子の数 33,791 遺伝子数由来ファイル V_Chambourcin_primary_genome_assembly_protein_sequences.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, BioNano optical map, Illumina 取得した配列量 28x (PacBio), 188.70x (Bionano), 40x (Illuminna)
アセンブリ方法 Hifiasm v0.13-r308, Bionano Solve v3.5.1, bowtie2 v2.3.4, samtools v1.9, minimap2 v2.17 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Allison Miller (Saint Louis University) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.46471/gigabyte.84 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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