配列名:V_Chambourcin_primary_genome_assembly
ゲノム配列名 | V_Chambourcin_primary_genome_assembly | 系統名 | cv. Chambourcin |
配列数 | 26 | 染色体数 | NA |
配列長 (bp) | 493,554,689 | N50長 (bp) | 23,325,629 |
遺伝子の数 | 33,791 | 遺伝子数由来ファイル | V_Chambourcin_primary_genome_assembly_protein_sequences.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II, BioNano optical map, Illumina | 取得した配列量 | 28x (PacBio), 188.70x (Bionano), 40x (Illuminna) |
アセンブリ方法 | Hifiasm v0.13-r308, Bionano Solve v3.5.1, bowtie2 v2.3.4, samtools v1.9, minimap2 v2.17 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Allison Miller (Saint Louis University) | データソース名 | Figshare |
論文 (DOIコード) | 10.46471/gigabyte.84 | データソースURL | https://figshare.com |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |