配列名:BartlettDHv2.0
ゲノム配列名 | BartlettDHv2.0 | 系統名 | Bartlett.DH |
配列数 | 494 | 染色体数 | 2n = 2x = 34 |
配列長 (bp) | 498,265,991 | N50長 (bp) | 24,780,778 |
遺伝子の数 | 37,445 | 遺伝子数由来ファイル | PyrusCommunis_BartlettDHv2.0.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 37,445 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Illumina, Bionano, Hi-C | 取得した配列量 | 63x |
アセンブリ方法 | Canu | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 527 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A double haploid derived from the variety Bartlett. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Michela Troggio (Fondazione Edmund Mach), Luca Bianco (ditto), Yves Van de Peer (Ghent University) | データソース名 | GDR: Genome Database For Rosaceae |
論文 (DOIコード) | 10.1093/gigascience/giz138 | データソースURL | https://www.rosaceae.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.2%[S:63.8%,D:34.4%],F:1.1%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:81.8%[S:65.3%,D:16.5%],F:8.8%,M:9.4%,n:1614 |