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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Pyrus communis , European pear , セイヨウナシ

Pyrus communis

Genome Assembly ID:t23211.G001

配列名:BartlettDHv2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 BartlettDHv2.0 系統名 Bartlett.DH
配列数 494 染色体数 2n = 2x = 34
配列長 (bp) 498,265,991 N50長 (bp) 24,780,778
遺伝子の数 37,445 遺伝子数由来ファイル PyrusCommunis_BartlettDHv2.0.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 37,445 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Bionano, Hi-C 取得した配列量 63x
アセンブリ方法 Canu 推定ゲノムサイズ (Mb) 527
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A double haploid derived from the variety Bartlett.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Michela Troggio (Fondazione Edmund Mach), Luca Bianco (ditto), Yves Van de Peer (Ghent University) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giz138 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.2%[S:63.8%,D:34.4%],F:1.1%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:81.8%[S:65.3%,D:16.5%],F:8.8%,M:9.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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