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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Hydrangea macrophylla , Hydrangea , アジサイ

Hydrangea macrophylla

Genome Assembly ID:t23110.G003

配列名:HMA_r1.2_1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 HMA_r1.2_1 系統名 Aogashima
配列数 3,780 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 2,227,567,818 N50長 (bp) 1,440,438
遺伝子の数 32,222 遺伝子数由来ファイル HMA_r1.2_1.protein.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 32,222 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio and Illumina 取得した配列量 49x
アセンブリ方法 FALCON_Unzip and FALCON_Phase 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,164
シーケンシングの方法のコメント HiC data by Illumina コメント Haplotype phase 1
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Nashima K (Nihon University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2020.06.14.151431 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:63.1%[S:60.0%,D:3.1%],F:2.4%,M:34.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:78.5%[S:74.7%,D:3.8%],F:10.2%,M:11.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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