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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Hydrangea macrophylla , Hydrangea , アジサイ

Hydrangea macrophylla

Genome Assembly ID:t23110.G001

配列名:HMA_r0.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 HMA_r0.1 系統名 Aogashima
配列数 613,685 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 1,714,141,309 N50長 (bp) 9,127
遺伝子の数 371,923 遺伝子数由来ファイル HMA_r0.1.augustus.gff3.pep.best.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 371,923 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 144x
アセンブリ方法 Platanus 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,164
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Nashima K (Nihon University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2020.06.14.151431 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:66.5%[S:63.9%,D:2.6%],F:21.9%,M:11.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:46.9%[S:44.7%,D:2.2%],F:28.8%,M:24.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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