配列名:HMA_r0.1
ゲノム配列名 | HMA_r0.1 | 系統名 | Aogashima |
配列数 | 613,685 | 染色体数 | 2n = 2x = 36 |
配列長 (bp) | 1,714,141,309 | N50長 (bp) | 9,127 |
遺伝子の数 | 371,923 | 遺伝子数由来ファイル | HMA_r0.1.augustus.gff3.pep.best.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 371,923 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 144x |
アセンブリ方法 | Platanus | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,164 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Nashima K (Nihon University) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2020.06.14.151431 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:66.5%[S:63.9%,D:2.6%],F:21.9%,M:11.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:46.9%[S:44.7%,D:2.2%],F:28.8%,M:24.3%,n:1614 |