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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Thymus quinquecostatus , Chinese native thymes , イブキジャコウソウ

Thymus quinquecostatus

Genome Assembly ID:t228974.G001

配列名:ASM2422231v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM2422231v1 系統名 NA (Wild accession)
配列数 478 染色体数 2n = x = 12
配列長 (bp) 528,675,121 N50長 (bp) 36,440,660
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C 取得した配列量 39.80x(PacBio)
アセンブリ方法 hifiasm (v0.12) 推定ゲノムサイズ (Mb) 536
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Material: Corrected from Jinhekou village in the Hebei province of China
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Lei Shi (Chinese Academy of Sciences) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1016/j.xplc.2022.100413 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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