配列名:A.monticola_all_genome_v1.2
ゲノム配列名 | A.monticola_all_genome_v1.2 | 系統名 | PI 263393 |
配列数 | 7,001 | 染色体数 | 2n = 4x = 40 |
配列長 (bp) | 2,618,824,336 | N50長 (bp) | 124,915,013 |
遺伝子の数 | 74,907 | 遺伝子数由来ファイル | A.monticola_all_genome_v1.2.pep |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 74,907 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Illumina, BioNano optical | 取得した配列量 | 197.1x |
アセンブリ方法 | AllPaths v. SCR_010742; Celera Assembler v. 1.5; Falcon v. falcon-kit 0.7; WTDBG v. 1.0; IrysView package v. 2.5.1; LACHESIS v. Dec-2017 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,700 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Dongmei Yin (Henan Agricultural University), Jinsong Zhang (Chinese Academy of Sciences) | データソース名 | GIGA DB |
論文 (DOIコード) | 10.1093/gigascience/giy066 | データソースURL | http://gigadb.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.2%[S:40.8%,D:57.4%],F:0.7%,M:1.1%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:92.1%[S:40.0%,D:52.1%],F:2.7%,M:5.2%,n:1614 |