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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Arachis monticola , Wild peanut (monticola) , ラッカセイ野生種 (monticola種)

Arachis monticola

Genome Assembly ID:t227691.G001

配列名:A.monticola_all_genome_v1.2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 A.monticola_all_genome_v1.2 系統名 PI 263393
配列数 7,001 染色体数 2n = 4x = 40
配列長 (bp) 2,618,824,336 N50長 (bp) 124,915,013
遺伝子の数 74,907 遺伝子数由来ファイル A.monticola_all_genome_v1.2.pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 74,907 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, BioNano optical 取得した配列量 197.1x
アセンブリ方法 AllPaths v. SCR_010742; Celera Assembler v. 1.5; Falcon v. falcon-kit 0.7; WTDBG v. 1.0; IrysView package v. 2.5.1; LACHESIS v. Dec-2017 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,700
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Dongmei Yin (Henan Agricultural University), Jinsong Zhang (Chinese Academy of Sciences) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giy066 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.2%[S:40.8%,D:57.4%],F:0.7%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:92.1%[S:40.0%,D:52.1%],F:2.7%,M:5.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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