Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Diospyros oleifera , Oily persimmon, You shi , アブラガキ

Diospyros oleifera

Genome Assembly ID:t227308.G002

配列名:Dol.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Dol.genome 系統名 NA
配列数 2,533 染色体数 2n = 2x = 30
配列長 (bp) 812,355,328 N50長 (bp) 45,442,152
遺伝子の数 30,530 遺伝子数由来ファイル Dol.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel, 10x Genomics, Hi-C 取得した配列量 114.88x (PacBio), 126.53x (10x)
アセンブリ方法 FALCON v.0.3, Long Ranger v2.1.2, FragScaff v. 1-1 推定ゲノムサイズ (Mb) 868
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jianmin Fu (Chinese Academy of Forestry) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giz164 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット