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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Punica granatum , Pomegranate , ザクロ

Punica granatum

Genome Assembly ID:t22663.G001

配列名:ASM765513v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM765513v2 系統名 Isolate Tunisia-2019
配列数 474 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 320,494,280 N50長 (bp) 39,957,110
遺伝子の数 36,608 遺伝子数由来ファイル GCF_007655135.1_ASM765513v2_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 36,608 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII 取得した配列量 60.0x
アセンブリ方法 Canu v. 1.5 推定ゲノムサイズ (Mb) 360
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shangyin Cao (Zhengzhou Fruit Tree Research Institute) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1111/pbi.13260 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:93.9%[S:92.0%,D:1.9%],F:3.9%,M:2.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.1%[S:60.8%,D:38.3%],F:0.4%,M:0.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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