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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Rhododendron ripense , - , キシツツジ

Rhododendron ripense

Genome Assembly ID:t224351.G001

配列名:RRI_r1.1.pmol

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 RRI_r1.1.pmol 系統名 Hi-Oni1
配列数 78 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 506,733,090 N50長 (bp) 37,020,540
遺伝子の数 34,606 遺伝子数由来ファイル RRI1.1.pmol.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 112x
アセンブリ方法 Falcon_Unzip 推定ゲノムサイズ (Mb) 527
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2021.06.17.448907 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.5%[S:90.7%,D:6.8%],F:1.3%,M:1.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:80.8%[S:74.0%,D:6.8%],F:8.9%,M:10.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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