配列名:RRI_r1.1.pmol
ゲノム配列名 | RRI_r1.1.pmol | 系統名 | Hi-Oni1 |
配列数 | 78 | 染色体数 | 2n = 2x = 26 |
配列長 (bp) | 506,733,090 | N50長 (bp) | 37,020,540 |
遺伝子の数 | 34,606 | 遺伝子数由来ファイル | RRI1.1.pmol.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 112x |
アセンブリ方法 | Falcon_Unzip | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 527 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2021.06.17.448907 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.5%[S:90.7%,D:6.8%],F:1.3%,M:1.2%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:80.8%[S:74.0%,D:6.8%],F:8.9%,M:10.3%,n:1614 |