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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Strobilanthes cusia , Assam indigo , リュウキュウアイ

Strobilanthes cusia

Genome Assembly ID:t222567.G002

配列名:ML

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ML 系統名 NA
配列数 108 染色体数 2n = 32
配列長 (bp) 912,615,014 N50長 (bp) 68,439,447
遺伝子の数 32,974 遺伝子数由来ファイル ML.protein.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio CCS, Hi-C 取得した配列量 52.73x (Ilumina), 532x (PacBio)
アセンブリ方法 hifiasm, ALLHiC 推定ゲノムサイズ (Mb) 948
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Daozhi Wei (Fujian Agriculture and Forestry University) データソース名 CNGBdb
論文 (DOIコード) 10.3389/fpls.2021.742420 データソースURL https://db.cngb.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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