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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Euscaphis japonica , Euscaphis japonica , ゴンズイ

Euscaphis japonica

Genome Assembly ID:t210332.G001

配列名:GWHBCHS00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBCHS00000000.genome 系統名 wild accession
配列数 122 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 1,199,999,138 N50長 (bp) 98,652,080
遺伝子の数 32,856 遺伝子数由来ファイル GWHBCHS00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 32,856 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Hi-C 取得した配列量 132.71_Gb(PacBio), 188.76_Gb(Hi-C
アセンブリ方法 FALCON 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,390
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shuang-Quan Zou (Fujian Agriculture and Forestry University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.15518 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:92.6%,D:5.8%],F:1.4%,M:0.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.6%[S:91.1%,D:5.5%],F:2.0%,M:1.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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